Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 GGA2YHR108W 1758 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 EDC1YGL222C 528 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 RSF1YMR030W 1131 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 YMC2YBR104W 990 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 IML3YBR107C 738 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 CCT5YJR064W 1689 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 YKL053WYKL053W 375 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 OMA1YKR087C 1038 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 ORT1YOR130C 879 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 UBS1YBR165W 834 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 DUR3YHL016C 2208 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 AMF1YOR378W 1548 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 CTI6YPL181W 1521 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 NUR1YDL089W 1455 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 SPR1YOR190W 1338 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 MDL2YPL270W 2322 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 EMC3YKL207W 762 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 SRM1YGL097W 1449 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 THI72YOR192C 1800 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 ENO2YHR174W 1314 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 SBP1YHL034C 885 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 FSH1YHR049W 732 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 ERG29YMR134W 714 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 YPL277CYPL277C 1464 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 SAN1YDR143C 1833 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 BUD31YCR063W 474 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 YNR048WYNR048W 1182 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 TFB4YPR056W 1017 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 CLB5YPR120C 1308 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 YLR072WYLR072W 2082 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 JJJ3YJR097W 519 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 EHD3YDR036C 1503 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 ERG12YMR208W 1332 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 TRP4YDR354W 1143 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 TAF11YML015C 1041 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 NUF2YOL069W 1356 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 MRS4YKR052C 915 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 snR4snR4 186 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 ADD66YKL206C 804 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 SRL2YLR082C 1179 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 MER1YNL210W 813 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 PCL1YNL289W 840 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 HAT1YPL001W 1125 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 ISY1YJR050W 708 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 RCE1YMR274C 948 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 MGR3YMR115W 1506 nt7.52□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 TPN1YGL186C 1740 nt7.52□□□□□ -1.2
TY1A-NL1Q12391 MMS2YGL087C 414 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 ESS1YJR017C 513 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 AIM2YAL049C 741 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 GFD1YMR255W 567 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 MHF1YOL086W-A 273 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 MCT1YOR221C 1083 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 DUS3YLR401C 2007 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 snR86snR86 1004 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 TPC1YGR096W 945 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 MRPS8YMR158W 468 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 OAZ1YPL052W 879 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 AAC3YBR085W 924 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 YBR138CYBR138C 1575 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 SRP54YPR088C 1626 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 RRP17YDR412W 708 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 YET2YMR040W 483 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 IDI1YPL117C 867 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 MCM5YLR274W 2328 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 MED2YDL005C 1296 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 LEU2YCL018W 1095 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 SAS4YDR181C 1446 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 FIT1YDR534C 1587 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 NAM8YHR086W 1572 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 ERV41YML067C 1059 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 GAS1YMR307W 1680 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 YJL195CYJL195C 702 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 LEA1YPL213W 717 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 POP2YNR052C 1302 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 CDS1YBR029C 1374 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 ADE16YLR028C 1776 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1A-NL1Q12391 OAC1YKL120W 975 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 DCP1YOL149W 696 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 RRS1YOR294W 612 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 PUS9YDL036C 1389 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 TMS1YDR105C 1422 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 TDH1YJL052W 999 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 REX2YLR059C 810 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 SSP2YOR242C 1116 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 BTS1YPL069C 1008 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 PTC6YCR079W 1329 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 DIA4YHR011W 1341 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 UFD1YGR048W 1086 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 POT1YIL160C 1254 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 TAF13YML098W 504 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YNL228WYNL228W 777 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 MLS1YNL117W 1665 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 ABP1YCR088W 1779 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YIL177CYIL177C 5277 nt7.43□□□□□ -1.22
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