Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 ARG7YMR062C 1326 nt8.75□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 BAP3YDR046C 1815 nt8.75□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 HIS3YOR202W 663 nt8.74□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 SPR1YOR190W 1338 nt8.74□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 TDA4YJR116W 840 nt8.73□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 CPT1YNL130C 1182 nt8.73□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 PNS1YOR161C 1620 nt8.72□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 MNN9YPL050C 1188 nt8.72□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 YLR358CYLR358C 564 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 APT1YML022W 564 nt8.71□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 YJL045WYJL045W 1905 nt8.7□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 STF1YDL130W-A 261 nt8.7□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 LEA1YPL213W 717 nt8.7□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 TGL5YOR081C 2250 nt8.69□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 GUT1YHL032C 2130 nt8.68□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 MRP7YNL005C 1116 nt8.68□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 HOG1YLR113W 1308 nt8.68□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 HXT11YOL156W 1704 nt8.68□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 INM1YHR046C 888 nt8.67□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 CSM2YIL132C 642 nt8.67□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 YNL140CYNL140C 570 nt8.67□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 DIP5YPL265W 1827 nt8.67□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 SNP1YIL061C 903 nt8.66□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 MIM1YOL026C 342 nt8.66□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 TIF3YPR163C 1311 nt8.65□□□□□ -1.02
CLF1Q12309 PAB1YER165W 1734 nt8.64□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 GLY1YEL046C 1164 nt8.64□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 YLR072WYLR072W 2082 nt8.64□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 ABP1YCR088W 1779 nt8.63□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 ALG7YBR243C 1347 nt8.62□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 ARO3YDR035W 1113 nt8.62□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 HBS1YKR084C 1836 nt8.61□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 NAS6YGR232W 687 nt8.6□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 SRM1YGL097W 1449 nt8.6□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 YML079WYML079W 606 nt8.59□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 CCR4YAL021C 2514 nt8.59□□□□□ -1.03
CLF1Q12309 STS1YIR011C 960 nt8.58□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 NCA3YJL116C 1014 nt8.58□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 TES1YJR019C 1050 nt8.57□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 MRN1YPL184C 1839 nt8.55□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 YPL247CYPL247C 1572 nt8.55□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 MAS2YHR024C 1449 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 NDE1YMR145C 1683 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 KTR4YBR199W 1395 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 UFD1YGR048W 1086 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 CPR2YHR057C 618 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 ERV2YPR037C 591 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 WSC4YHL028W 1818 nt8.54□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 DUS3YLR401C 2007 nt8.53□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.53□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 RPR1RPR1 369 nt8.53□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 MTC6YHR151C 1581 nt8.52□□□□□ -1.04
CLF1Q12309 RRP43YCR035C 1185 nt8.52□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 DST1YGL043W 930 nt8.52□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 INP54YOL065C 1155 nt8.52□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 ORT1YOR130C 879 nt8.52□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 STE3YKL178C 1413 nt8.52□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 PUP2YGR253C 783 nt8.51□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 YJR142WYJR142W 1029 nt8.51□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 FTH1YBR207W 1398 nt8.5□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 PSA1YDL055C 1086 nt8.5□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 CRN1YLR429W 1956 nt8.5□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 OSM1YJR051W 1506 nt8.49□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 YGL081WYGL081W 963 nt8.49□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 HAM1YJR069C 594 nt8.49□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 AOS1YPR180W 1044 nt8.49□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 snR4snR4 186 nt8.49□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 FIT1YDR534C 1587 nt8.48□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 YNL295WYNL295W 1575 nt8.48□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 YBL111CYBL111C 2004 nt8.48□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 COS10YNR075W 1125 nt8.48□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 MSI1YBR195C 1269 nt8.48□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 ECM27YJR106W 2178 nt8.48□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 DOC1YGL240W 753 nt8.47□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt8.47□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 ATP23YNR020C 813 nt8.47□□□□□ -1.05
CLF1Q12309 YHR033WYHR033W 1272 nt8.46□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 PIH1YHR034C 1035 nt8.46□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 YPT10YBR264C 600 nt8.46□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 GET2YER083C 858 nt8.44□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 NMA2YGR010W 1188 nt8.44□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 ELP6YMR312W 822 nt8.44□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 PMA2YPL036W 2844 nt8.44□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 SLM3YDL033C 1254 nt8.43□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 CDA1YLR307W 906 nt8.43□□□□□ -1.06
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