Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 ECM27YJR106W 2178 nt9.01□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 ABP1YCR088W 1779 nt9□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 YNL165WYNL165W 1221 nt9□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 YRF1-3YGR296W 5580 nt9□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 YRF1-6YNL339C 5580 nt9□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 YRF1-7YPL283C 5580 nt9□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 TOS1YBR162C 1368 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 TDA4YJR116W 840 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 WSC3YOL105C 1671 nt8.99□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 ADE1YAR015W 921 nt8.98□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 DIP5YPL265W 1827 nt8.98□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 NUP53YMR153W 1428 nt8.97□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 TGL5YOR081C 2250 nt8.96□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 YJL043WYJL043W 774 nt8.95□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 YIL177CYIL177C 5277 nt8.95□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 GLY1YEL046C 1164 nt8.94□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 INM1YHR046C 888 nt8.94□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 KAE1YKR038C 1161 nt8.94□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 YNL140CYNL140C 570 nt8.94□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 MRP7YNL005C 1116 nt8.93□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 MIM1YOL026C 342 nt8.93□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 ARG7YMR062C 1326 nt8.93□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 TIF3YPR163C 1311 nt8.93□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 ADE2YOR128C 1716 nt8.93□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 ARO3YDR035W 1113 nt8.92□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 ALG7YBR243C 1347 nt8.91□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 YJL211CYJL211C 444 nt8.91□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 YHM2YMR241W 945 nt8.91□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 PSP2YML017W 1782 nt8.91□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 SNP1YIL061C 903 nt8.9□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 ORT1YOR130C 879 nt8.9□□□□□ -0.98
SSF2Q12153 MRN1YPL184C 1839 nt8.89□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 APT1YML022W 564 nt8.89□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 FUS3YBL016W 1062 nt8.89□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 MNN9YPL050C 1188 nt8.89□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 PET494YNR045W 1470 nt8.89□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 HAC1YFL031W 717 nt8.88□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 YJL045WYJL045W 1905 nt8.88□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 YOR072WYOR072W 315 nt8.87□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 WSC4YHL028W 1818 nt8.87□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 SPR1YOR190W 1338 nt8.86□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 YPL277CYPL277C 1464 nt8.86□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 YDR476CYDR476C 675 nt8.86□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 HBS1YKR084C 1836 nt8.86□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 PNS1YOR161C 1620 nt8.85□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 CPT1YNL130C 1182 nt8.85□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 RTG2YGL252C 1767 nt8.85□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 UBP13YBL067C 2244 nt8.85□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 YEL023CYEL023C 2049 nt8.85□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 EEB1YPL095C 1371 nt8.85□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 EDC2YER035W 438 nt8.84□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 RRT6YGL146C 936 nt8.84□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 YKR023WYKR023W 1593 nt8.84□□□□□ -0.99
SSF2Q12153 SWP1YMR149W 861 nt8.82□□□□□ -1
SSF2Q12153 YOR268CYOR268C 399 nt8.82□□□□□ -1
SSF2Q12153 KTR4YBR199W 1395 nt8.82□□□□□ -1
SSF2Q12153 TOM71YHR117W 1920 nt8.8□□□□□ -1
SSF2Q12153 MTC6YHR151C 1581 nt8.8□□□□□ -1
SSF2Q12153 MAK32YCR019W 1092 nt8.79□□□□□ -1
SSF2Q12153 snR4snR4 186 nt8.79□□□□□ -1
SSF2Q12153 DST1YGL043W 930 nt8.78□□□□□ -1
SSF2Q12153 GCD11YER025W 1584 nt8.78□□□□□ -1
SSF2Q12153 DUR3YHL016C 2208 nt8.76□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 CPR2YHR057C 618 nt8.76□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 ELP6YMR312W 822 nt8.76□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 MAM3YOL060C 2121 nt8.75□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 YLR358CYLR358C 564 nt8.75□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 AOS1YPR180W 1044 nt8.75□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 ALD5YER073W 1563 nt8.74□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 NCA3YJL116C 1014 nt8.74□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 HAM1YJR069C 594 nt8.74□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.73□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 DIA4YHR011W 1341 nt8.73□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 STE3YKL178C 1413 nt8.72□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 HXK1YFR053C 1458 nt8.72□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 CDA1YLR307W 906 nt8.72□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 MEX67YPL169C 1800 nt8.72□□□□□ -1.01
SSF2Q12153 TES1YJR019C 1050 nt8.71□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 RRP43YCR035C 1185 nt8.7□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 ERV2YPR037C 591 nt8.7□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 BAP3YDR046C 1815 nt8.7□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 YNL295WYNL295W 1575 nt8.69□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 INP54YOL065C 1155 nt8.69□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 YHR033WYHR033W 1272 nt8.68□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 STS1YIR011C 960 nt8.68□□□□□ -1.02
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