Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	CDC23	YHR166C	1881 nt		7.45	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	GTS1	YGL181W	1191 nt		7.45	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	HRA1	HRA1	564 nt		7.45	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	TES1	YJR019C	1050 nt		7.45	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	TPO1	YLL028W	1761 nt		7.45	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	PDC6	YGR087C	1692 nt		7.42	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	SRP102	YKL154W	735 nt		7.42	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	CDA1	YLR307W	906 nt		7.42	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	YLR349W	YLR349W	507 nt		7.42	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	CMK2	YOL016C	1344 nt		7.42	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	PPZ2	YDR436W	2133 nt		7.42	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	EDC3	YEL015W	1656 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	DCR2	YLR361C	1737 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	FLX1	YIL134W	936 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	YLR280C	YLR280C	351 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	ELP6	YMR312W	822 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	RHO1	YPR165W	630 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	CAN1	YEL063C	1773 nt		7.41	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	YBL113C	YBL113C	2379 nt		7.4	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	PUP3	YER094C	618 nt		7.4	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	YHL030W-A	YHL030W-A	462 nt		7.4	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	SNA3	YJL151C	402 nt		7.4	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	CYC3	YAL039C	810 nt		7.4	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	MTC6	YHR151C	1581 nt		7.4	□□□□□ -1.22
VIK1	Q12045	ICL2	YPR006C	1728 nt		7.4	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	YOR389W	YOR389W	1875 nt		7.4	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	OCH1	YGL038C	1443 nt		7.39	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	LEO1	YOR123C	1395 nt		7.39	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	SRF1	YDL133W	1314 nt		7.39	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	PAU5	YFL020C	369 nt		7.39	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	SNP1	YIL061C	903 nt		7.38	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	RCF2	YNR018W	675 nt		7.38	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	THI73	YLR004C	1572 nt		7.37	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	STP3	YLR375W	1032 nt		7.37	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	HXT8	YJL214W	1710 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)D	tA(AGC)D	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)F	tA(AGC)F	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)G	tA(AGC)G	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)H	tA(AGC)H	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)J	tA(AGC)J	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)K1	tA(AGC)K1	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)K2	tA(AGC)K2	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)L	tA(AGC)L	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)M1	tA(AGC)M1	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)M2	tA(AGC)M2	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	tA(AGC)P	tA(AGC)P	73 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	SSC1	YJR045C	1965 nt		7.36	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	ERO1	YML130C	1692 nt		7.35	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	FLC2	YAL053W	2352 nt		7.34	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	SHC1	YER096W	1539 nt		7.34	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	YJL043W	YJL043W	774 nt		7.34	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	IPL1	YPL209C	1104 nt		7.34	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	SMC5	YOL034W	3282 nt		7.34	□□□□□ -1.23
VIK1	Q12045	CAK1	YFL029C	1107 nt		7.33	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	YMR166C	YMR166C	1107 nt		7.33	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	ADH6	YMR318C	1083 nt		7.33	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	ADH7	YCR105W	1086 nt		7.32	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	MEU1	YLR017W	1014 nt		7.32	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	PGC1	YPL206C	966 nt		7.32	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	BAP3	YDR046C	1815 nt		7.31	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	YPT31	YER031C	672 nt		7.31	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	AIM2	YAL049C	741 nt		7.31	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	ENB1	YOL158C	1821 nt		7.31	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	AGP2	YBR132C	1791 nt		7.31	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	CKI1	YLR133W	1749 nt		7.3	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	TPI1	YDR050C	747 nt		7.3	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	PRE10	YOR362C	867 nt		7.3	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	TCB1	YOR086C	3561 nt		7.3	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	MSS51	YLR203C	1311 nt		7.29	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	HEL1	YKR017C	1656 nt		7.29	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	SNF4	YGL115W	969 nt		7.29	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	PAC10	YGR078C	600 nt		7.29	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	RQC1	YDR333C	2172 nt		7.28	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	CRN1	YLR429W	1956 nt		7.28	□□□□□ -1.24
VIK1	Q12045	PAU15	YIR041W	375 nt		7.27	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	YOR012W	YOR012W	414 nt		7.27	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	MNN9	YPL050C	1188 nt		7.27	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	AOS1	YPR180W	1044 nt		7.27	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	ECM27	YJR106W	2178 nt		7.27	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	HNM1	YGL077C	1692 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	YCR041W	YCR041W	333 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	RRT14	YIL127C	621 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	HAM1	YJR069C	594 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	SNF7	YLR025W	723 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	RTC2	YBR147W	891 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	TIM50	YPL063W	1431 nt		7.26	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	KIN1	YDR122W	3195 nt		7.25	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	HHY1	YEL059W	309 nt		7.25	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	YBR232C	YBR232C	360 nt		7.25	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	ARG7	YMR062C	1326 nt		7.25	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	YCR025C	YCR025C	411 nt		7.24	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	PET10	YKR046C	852 nt		7.24	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	LOT6	YLR011W	576 nt		7.24	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	VTS1	YOR359W	1572 nt		7.24	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	SER2	YGR208W	930 nt		7.23	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	YGR210C	YGR210C	1236 nt		7.23	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	YHR033W	YHR033W	1272 nt		7.23	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	PMU1	YKL128C	888 nt		7.23	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	LSP1	YPL004C	1026 nt		7.23	□□□□□ -1.25
VIK1	Q12045	SEC23	YPR181C	2307 nt		7.23	□□□□□ -1.25

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