Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CPSF1Q10570 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CPSF1Q10570 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CPSF1Q10570 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPSF1Q10570 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CPSF1Q10570 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPSF1Q10570 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
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