Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shisal1Q0VBP7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal1Q0VBP7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms