Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
StumQ0VBF8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StumQ0VBF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StumQ0VBF8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms