Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMAGPQ0VAQ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms