Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGEF1BQ0VAM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGEF1BQ0VAM2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms