Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5aQ0V8T9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntnap5aQ0V8T9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap5aQ0V8T9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap5aQ0V8T9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntnap5aQ0V8T9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.8 ms