Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC15Q0P6D6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC15Q0P6D6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC15Q0P6D6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms