Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cib3Q0P523 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cib3Q0P523 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms