Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBL2Q08999 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBL2Q08999 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBL2Q08999 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBL2Q08999 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBL2Q08999 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms