Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp2Q08652 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp2Q08652 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rbp2Q08652 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms