Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 STE3YKL178C 1413 nt9.23□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 RRP43YCR035C 1185 nt9.23□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 CPR2YHR057C 618 nt9.23□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 CYS3YAL012W 1185 nt9.23□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 PSA1YDL055C 1086 nt9.22□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 MRP7YNL005C 1116 nt9.22□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 TGL5YOR081C 2250 nt9.21□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 YLR072WYLR072W 2082 nt9.21□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 YML034C-AYML034C-A 399 nt9.21□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YPQ1YOL092W 927 nt9.21□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 CDC3YLR314C 1563 nt9.2□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 AIM46YHR199C 933 nt9.2□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 ADH6YMR318C 1083 nt9.2□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 OSM1YJR051W 1506 nt9.2□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YNL295WYNL295W 1575 nt9.2□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 DST1YGL043W 930 nt9.19□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 INP54YOL065C 1155 nt9.19□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 GLY1YEL046C 1164 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 TRR2YHR106W 1029 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 HRB1YNL004W 1365 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YOR111WYOR111W 699 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 MCP1YOR228C 909 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 CST26YBR042C 1194 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YPL067CYPL067C 597 nt9.18□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 ABP1YCR088W 1779 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 INM1YHR046C 888 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 LEA1YPL213W 717 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 PUS7YOR243C 2031 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YRF1-3YGR296W 5580 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YRF1-6YNL339C 5580 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 YRF1-7YPL283C 5580 nt9.17□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 WSC4YHL028W 1818 nt9.15□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 PRS4YBL068W 981 nt9.15□□□□□ -0.94
SSP2Q08646 SPS1YDR523C 1473 nt9.15□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 YNL140CYNL140C 570 nt9.14□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 MBF1YOR298C-A 456 nt9.14□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 FET5YFL041W 1869 nt9.14□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 HXT11YOL156W 1704 nt9.14□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 PUS4YNL292W 1212 nt9.13□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 TIF3YPR163C 1311 nt9.12□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 PRY2YKR013W 990 nt9.12□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 AAD14YNL331C 1131 nt9.12□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 SPE3YPR069C 882 nt9.12□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 MRN1YPL184C 1839 nt9.11□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 ZIM17YNL310C 525 nt9.11□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 YPT10YBR264C 600 nt9.11□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 DTR1YBR180W 1719 nt9.11□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 RFC1YOR217W 2586 nt9.1□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 SRY1YKL218C 981 nt9.1□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 LGE1YPL055C 999 nt9.1□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 MTC6YHR151C 1581 nt9.1□□□□□ -0.95
SSP2Q08646 HAM1YJR069C 594 nt9.08□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 DSC3YOR223W 879 nt9.08□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 AOS1YPR180W 1044 nt9.08□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 PPZ2YDR436W 2133 nt9.08□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 SFP1YLR403W 2052 nt9.08□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 NBA1YOL070C 1506 nt9.07□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 PIL1YGR086C 1020 nt9.07□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 YER152CYER152C 1332 nt9.06□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 SRM1YGL097W 1449 nt9.06□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 GET2YER083C 858 nt9.06□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 PLB3YOL011W 2061 nt9.05□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 SKP1YDR328C 585 nt9.05□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 YML122CYML122C 381 nt9.04□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 KTR4YBR199W 1395 nt9.03□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 ELP6YMR312W 822 nt9.03□□□□□ -0.96
SSP2Q08646 YHR033WYHR033W 1272 nt9.02□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 TPO4YOR273C 1980 nt9.02□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 MAE1YKL029C 2010 nt9.01□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 YIL177CYIL177C 5277 nt9.01□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 ILV2YMR108W 2064 nt9□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 DML1YMR211W 1428 nt9□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 PAM17YKR065C 594 nt8.99□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 YPC1YBR183W 951 nt8.99□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 NFS1YCL017C 1494 nt8.98□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 MPH3YJR160C 1809 nt8.97□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 CDA1YLR307W 906 nt8.97□□□□□ -0.97
SSP2Q08646 PDA1YER178W 1263 nt8.96□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 snR30snR30 606 nt8.96□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 NPP1YCR026C 2229 nt8.96□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 BIO3YNR058W 1443 nt8.96□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 DAL80YKR034W 810 nt8.95□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 MET8YBR213W 825 nt8.95□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 SML1YML058W 315 nt8.94□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 FTH1YBR207W 1398 nt8.94□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 GNP1YDR508C 1992 nt8.93□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 YLR162WYLR162W 357 nt8.93□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 LDB7YBL006C 543 nt8.93□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 DCR2YLR361C 1737 nt8.92□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 POR2YIL114C 846 nt8.92□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 ERV25YML012W 636 nt8.92□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 CYS4YGR155W 1524 nt8.91□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 NAF1YNL124W 1479 nt8.91□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 OPI1YHL020C 1215 nt8.91□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.9□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.9□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.9□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.9□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.9□□□□□ -0.98
SSP2Q08646 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.3 ms