Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DSC1Q08554 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSC1Q08554 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC1Q08554 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSC1Q08554 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSC1Q08554 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSC1Q08554 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms