Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SOS1Q07889 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SOS1Q07889 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SOS1Q07889 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SOS1Q07889 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SOS1Q07889 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SOS1Q07889 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SOS1Q07889 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SOS1Q07889 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SOS1Q07889 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SOS1Q07889 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SOS1Q07889 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SOS1Q07889 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms