Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 IDP3YNL009W 1263 nt7.63□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 CTR1YPR124W 1221 nt7.63□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 CTI6YPL181W 1521 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YGR011WYGR011W 327 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 SBP1YHL034C 885 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 MRS3YJL133W 945 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YLR349WYLR349W 507 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 TIF34YMR146C 1044 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 COA2YPL189C-A 207 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 NDE2YDL085W 1638 nt7.62□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 PMA2YPL036W 2844 nt7.61□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 LYS20YDL182W 1287 nt7.61□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YHR054CYHR054C 1065 nt7.61□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 SPS100YHR139C 981 nt7.61□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YMR253CYMR253C 1245 nt7.61□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YER152CYER152C 1332 nt7.6□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.6□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 GAT1YFL021W 1533 nt7.6□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 HXT9YJL219W 1704 nt7.6□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 HAL5YJL165C 2568 nt7.6□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 WSC4YHL028W 1818 nt7.59□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 YJR056CYJR056C 711 nt7.59□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 MHF1YOL086W-A 273 nt7.59□□□□□ -1.19
BRE4Q07660 ERR3YMR323W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 ERR1YOR393W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 ERR2YPL281C 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 TAF13YML098W 504 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 YNL165WYNL165W 1221 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 CTF3YLR381W 2202 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 MMS21YEL019C 804 nt7.57□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 SIR2YDL042C 1689 nt7.57□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.57□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 RAD51YER095W 1203 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 CPD1YGR247W 720 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 PRM4YPL156C 855 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 SLX1YBR228W 915 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 AMF1YOR378W 1548 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 EEB1YPL095C 1371 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 RRT6YGL146C 936 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 YMR114CYMR114C 1107 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 YOL107WYOL107W 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 POT1YIL160C 1254 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 RMA1YKL132C 1293 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 MET13YGL125W 1803 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 ECM10YEL030W 1935 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 ECM9YKR004C 1134 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 YLR283WYLR283W 945 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 OCA1YNL099C 717 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 YOR300WYOR300W 309 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE4Q07660 MEP1YGR121C 1479 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 LYS12YIL094C 1116 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YJL009WYJL009W 327 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 MSA2YKR077W 1092 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YNL140CYNL140C 570 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YNL303WYNL303W 348 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YNL319WYNL319W 441 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 OSW1YOR255W 837 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 TIF3YPR163C 1311 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 ADH7YCR105W 1086 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 PAR32YDL173W 888 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 MAF1YDR005C 1188 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 RRP1YDR087C 837 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YJL211CYJL211C 444 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 CSI1YMR025W 888 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 PEX12YMR026C 1200 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 MRN1YPL184C 1839 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 SGF73YGL066W 1974 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 ATO2YNR002C 849 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 YPR150WYPR150W 522 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 TMS1YDR105C 1422 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 SAM50YNL026W 1455 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 NUF2YOL069W 1356 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 AQR1YNL065W 1761 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 NDE1YMR145C 1683 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 LIP2YLR239C 987 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 SUT2YPR009W 807 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 PAU15YIR041W 375 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 snR34snR34 203 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 INO1YJL153C 1602 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 ENO2YHR174W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 NIF3YGL221C 867 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 POB3YML069W 1659 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 TUB4YLR212C 1422 nt7.46□□□□□ -1.21
BRE4Q07660 GSF2YML048W 1212 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 RER1YCL001W 567 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 PUS9YDL036C 1389 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 SRP54YPR088C 1626 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 GAS1YMR307W 1680 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 MIX17YMR002W 471 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 YBR056WYBR056W 1506 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 MAS2YHR024C 1449 nt7.44□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 RAI1YGL246C 1164 nt7.44□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 TPC1YGR096W 945 nt7.44□□□□□ -1.22
BRE4Q07660 YGR283CYGR283C 1026 nt7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms