Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col9a2Q07643 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col9a2Q07643 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col9a2Q07643 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col9a2Q07643 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms