Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CXCL9Q07325 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CXCL9Q07325 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CXCL9Q07325 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CXCL9Q07325 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CXCL9Q07325 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms