Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Caprin2Q05A80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Caprin2Q05A80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Caprin2Q05A80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin2Q05A80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms