Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprgQ05909 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprgQ05909 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprgQ05909 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprgQ05909 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprgQ05909 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtprgQ05909 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtprgQ05909 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtprgQ05909 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PtprgQ05909 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprgQ05909 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PtprgQ05909 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PtprgQ05909 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprgQ05909 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprgQ05909 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprgQ05909 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprgQ05909 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprgQ05909 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprgQ05909 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprgQ05909 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprgQ05909 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms