Protein–RNA interactions for Protein: Q05789

ATG38, Autophagy-related protein 38, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG38Q05789 HAL5YJL165C 2568 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 PUP3YER094C 618 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 POP2YNR052C 1302 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 YMR206WYMR206W 942 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 YPR084WYPR084W 1371 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 KTR4YBR199W 1395 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 RCR1YBR005W 642 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 YPL108WYPL108W 507 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 LRO1YNR008W 1986 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 RNA170RNA170 169 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 PRE10YOR362C 867 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 HSM3YBR272C 1443 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG38Q05789 MLS1YNL117W 1665 nt7.4□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 TOS2YGR221C 1869 nt7.4□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 PMU1YKL128C 888 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 MDH2YOL126C 1134 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 YCP4YCR004C 744 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 YMR007WYMR007W 381 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 GPA1YHR005C 1419 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 PFS2YNL317W 1398 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 MRN1YPL184C 1839 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 DIP5YPL265W 1827 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 TOP3YLR234W 1971 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 DUS3YLR401C 2007 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 YOR041CYOR041C 432 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG38Q05789 SAM50YNL026W 1455 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 SLM3YDL033C 1254 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 MNN9YPL050C 1188 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 HSV2YGR223C 1347 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 AIM34YMR003W 597 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 RGT2YDL138W 2292 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 SNP1YIL061C 903 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 YER152CYER152C 1332 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 ALG7YBR243C 1347 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 TIM50YPL063W 1431 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 ARO3YDR035W 1113 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 MFT1YML062C 1179 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 CDC13YDL220C 2775 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 ARG7YMR062C 1326 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 MAS2YHR024C 1449 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 TES1YJR019C 1050 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 SGE1YPR198W 1632 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 HXT8YJL214W 1710 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 ATO2YNR002C 849 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 WSC4YHL028W 1818 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 DAL4YIR028W 1908 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG38Q05789 SHC1YER096W 1539 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 CDA1YLR307W 906 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 PUP1YOR157C 786 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 RSC9YML127W 1746 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 CKB1YGL019W 837 nt7.26□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 ATP10YLR393W 840 nt7.26□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 RRT6YGL146C 936 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 SLG1YOR008C 1137 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 RPS6AYPL090C 711 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 RPS6BYBR181C 711 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 HGH1YGR187C 1185 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 BXI1YNL305C 894 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 SWM1YDR260C 513 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 YER156CYER156C 1017 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 FCP1YMR277W 2199 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 JHD1YER051W 1479 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 MTC6YHR151C 1581 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 YPL264CYPL264C 1062 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 ITR1YDR497C 1755 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG38Q05789 YHR033WYHR033W 1272 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 YJL160CYJL160C 864 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 AVL9YLR114C 2295 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 CHA1YCL064C 1083 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 HAM1YJR069C 594 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 YJR154WYJR154W 1041 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 PET10YKR046C 852 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 PMT7YDR307W 1989 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 AOS1YPR180W 1044 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 AIM3YBR108W 2844 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 PET18YCR020C 648 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 RBS1YDL189W 1374 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 MET13YGL125W 1803 nt7.17□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 ATP2YJR121W 1536 nt7.17□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 EDC3YEL015W 1656 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 ELP6YMR312W 822 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 TDH1YJL052W 999 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 RTC2YBR147W 891 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG38Q05789 YLL058WYLL058W 1728 nt7.15□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 ACO1YLR304C 2337 nt7.15□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 SGF73YGL066W 1974 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 YIA6YIL006W 1122 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 SNF7YLR025W 723 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 VTS1YOR359W 1572 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 AGP2YBR132C 1791 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 FET4YMR319C 1659 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG38Q05789 LEO1YOR123C 1395 nt7.13□□□□□ -1.27
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