Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn1Q05186 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcn1Q05186 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rcn1Q05186 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcn1Q05186 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms