Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMX1Q04741 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMX1Q04741 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX1Q04741 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms