Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLE4Q04727 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TLE4Q04727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLE4Q04727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLE4Q04727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms