Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 RPS6BYBR181C 711 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 ELP4YPL101W 1371 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 THI3YDL080C 1830 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 UTR5YEL035C 501 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 TDH1YJL052W 999 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YJR149WYJR149W 1215 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 BUB2YMR055C 921 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 PFS2YNL317W 1398 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 PDC6YGR087C 1692 nt7.52□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 EDC2YER035W 438 nt7.52□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 RHO1YPR165W 630 nt7.51□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 TMS1YDR105C 1422 nt7.51□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 TOS1YBR162C 1368 nt7.5□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 MRS4YKR052C 915 nt7.5□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 BXI1YNL305C 894 nt7.5□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 SRM1YGL097W 1449 nt7.5□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 KAE1YKR038C 1161 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 HSV2YGR223C 1347 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 MFG1YDL233W 1377 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 CDC13YDL220C 2775 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 TOS2YGR221C 1869 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 YER152CYER152C 1332 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 THI73YLR004C 1572 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 PRP2YNR011C 2631 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 YDR476CYDR476C 675 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 SDH8YBR269C 417 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 snR4snR4 186 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 FCP1YMR277W 2199 nt7.46□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 HSM3YBR272C 1443 nt7.46□□□□□ -1.21
RRN11Q04712 YJL043WYJL043W 774 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 PMU1YKL128C 888 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 AAC3YBR085W 924 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 PET494YNR045W 1470 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YLR072WYLR072W 2082 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 DAL7YIR031C 1665 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ADE1YAR015W 921 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 FUS3YBL016W 1062 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 PRE5YMR314W 705 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ADE17YMR120C 1779 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 PRC1YMR297W 1599 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ECM27YJR106W 2178 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 NUP53YMR153W 1428 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YMR253CYMR253C 1245 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 NME1NME1 340 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ASN2YGR124W 1719 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 NMD5YJR132W 3147 nt7.43□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ATP2YJR121W 1536 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 snR86snR86 1004 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 PUP3YER094C 618 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 RNA170RNA170 169 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 PRE10YOR362C 867 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 HOG1YLR113W 1308 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ERR3YMR323W 1314 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ERR1YOR393W 1314 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 ERR2YPL281C 1314 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YIL168WYIL168W 384 nt7.41□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 FTH1YBR207W 1398 nt7.41□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 LEA1YPL213W 717 nt7.4□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 YOS9YDR057W 1629 nt7.4□□□□□ -1.22
RRN11Q04712 DIA4YHR011W 1341 nt7.39□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 SLM3YDL033C 1254 nt7.39□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 SPE4YLR146C 903 nt7.39□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 YIP4YGL198W 708 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 CIR2YOR356W 1896 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 EDC3YEL015W 1656 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 YGR137WYGR137W 375 nt7.37□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.37□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 AQR1YNL065W 1761 nt7.37□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 YJR154WYJR154W 1041 nt7.36□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 RCF1YML030W 480 nt7.35□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 PSP2YML017W 1782 nt7.35□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 YBR056WYBR056W 1506 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 HIS3YOR202W 663 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 TIM50YPL063W 1431 nt7.34□□□□□ -1.23
RRN11Q04712 SGE1YPR198W 1632 nt7.34□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 ABP1YCR088W 1779 nt7.33□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 MEP1YGR121C 1479 nt7.33□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 YLR358CYLR358C 564 nt7.33□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 YEN1YER041W 2280 nt7.32□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 VTS1YOR359W 1572 nt7.32□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 YBL111CYBL111C 2004 nt7.31□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 AGP2YBR132C 1791 nt7.31□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 JHD1YER051W 1479 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 RRT6YGL146C 936 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 CPT1YNL130C 1182 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 ACO1YLR304C 2337 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 SHC1YER096W 1539 nt7.3□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 HAC1YFL031W 717 nt7.29□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 MDH2YOL126C 1134 nt7.29□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 SPR1YOR190W 1338 nt7.28□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 NDE2YDL085W 1638 nt7.28□□□□□ -1.24
RRN11Q04712 ICL2YPR006C 1728 nt7.27□□□□□ -1.25
RRN11Q04712 PNS1YOR161C 1620 nt7.27□□□□□ -1.25
RRN11Q04712 ARG7YMR062C 1326 nt7.26□□□□□ -1.25
RRN11Q04712 POB3YML069W 1659 nt7.25□□□□□ -1.25
RRN11Q04712 EHT1YBR177C 1356 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms