Protein–RNA interactions for Protein: Q04119

PPN1, Endopolyphosphatase, yeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPN1	Q04119	ADE1	YAR015W	921 nt		7.79	□□□□□ -1.16
PPN1	Q04119	YLR122C	YLR122C	378 nt		7.78	□□□□□ -1.16
PPN1	Q04119	TOS1	YBR162C	1368 nt		7.78	□□□□□ -1.16
PPN1	Q04119	YJL043W	YJL043W	774 nt		7.77	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	PUS5	YLR165C	765 nt		7.77	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	NUP53	YMR153W	1428 nt		7.77	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	KDX1	YKL161C	1302 nt		7.77	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	FUS3	YBL016W	1062 nt		7.76	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	PRE10	YOR362C	867 nt		7.76	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	YIL168W	YIL168W	384 nt		7.75	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	KAE1	YKR038C	1161 nt		7.74	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	HIS3	YOR202W	663 nt		7.74	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	TIM50	YPL063W	1431 nt		7.74	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	YHL030W-A	YHL030W-A	462 nt		7.73	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	ARA2	YMR041C	1008 nt		7.73	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	MEP1	YGR121C	1479 nt		7.73	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	PET494	YNR045W	1470 nt		7.73	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	SHC1	YER096W	1539 nt		7.73	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	EHT1	YBR177C	1356 nt		7.72	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	ABP1	YCR088W	1779 nt		7.72	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	YDR476C	YDR476C	675 nt		7.72	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	PFS2	YNL317W	1398 nt		7.71	□□□□□ -1.17
PPN1	Q04119	JHD1	YER051W	1479 nt		7.71	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	RCF1	YML030W	480 nt		7.71	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	MFG1	YDL233W	1377 nt		7.71	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	YGR137W	YGR137W	375 nt		7.69	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	FRA1	YLL029W	2250 nt		7.69	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	LRO1	YNR008W	1986 nt		7.69	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	PSP2	YML017W	1782 nt		7.69	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	MDH2	YOL126C	1134 nt		7.68	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	FHN1	YGR131W	525 nt		7.67	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	REG2	YBR050C	1017 nt		7.67	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	NDE2	YDL085W	1638 nt		7.67	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	HXT8	YJL214W	1710 nt		7.66	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	TOM20	YGR082W	552 nt		7.66	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	BNS1	YGR230W	414 nt		7.66	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	REC114	YMR133W	1287 nt		7.66	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	TIF3	YPR163C	1311 nt		7.66	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	BUD31	YCR063W	474 nt		7.65	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	SLM3	YDL033C	1254 nt		7.65	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	HSV2	YGR223C	1347 nt		7.65	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	WSC3	YOL105C	1671 nt		7.65	□□□□□ -1.18
PPN1	Q04119	LPD1	YFL018C	1500 nt		7.64	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	PRE5	YMR314W	705 nt		7.64	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	CPT1	YNL130C	1182 nt		7.64	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	BAP3	YDR046C	1815 nt		7.64	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	SPR1	YOR190W	1338 nt		7.63	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		7.63	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	YNL140C	YNL140C	570 nt		7.63	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	DIP5	YPL265W	1827 nt		7.63	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	ARG7	YMR062C	1326 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	HAC1	YFL031W	717 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	RRT6	YGL146C	936 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	TDA4	YJR116W	840 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	ATG17	YLR423C	1254 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	IDP3	YNL009W	1263 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	MLS1	YNL117W	1665 nt		7.62	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	PMT7	YDR307W	1989 nt		7.61	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	INO1	YJL153C	1602 nt		7.61	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	GLY1	YEL046C	1164 nt		7.61	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	PNS1	YOR161C	1620 nt		7.6	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	ATG22	YCL038C	1587 nt		7.6	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	YNL165W	YNL165W	1221 nt		7.6	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	HOG1	YLR113W	1308 nt		7.59	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	SDH8	YBR269C	417 nt		7.59	□□□□□ -1.19
PPN1	Q04119	TGL5	YOR081C	2250 nt		7.58	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	YEL034C-A	YEL034C-A	603 nt		7.58	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	INM1	YHR046C	888 nt		7.58	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	YLR358C	YLR358C	564 nt		7.57	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	APT1	YML022W	564 nt		7.57	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	MRN1	YPL184C	1839 nt		7.57	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	WSC4	YHL028W	1818 nt		7.55	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	RPL2A	YFR031C-A	765 nt		7.54	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	MNN9	YPL050C	1188 nt		7.54	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	MRP7	YNL005C	1116 nt		7.53	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	ALG7	YBR243C	1347 nt		7.52	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	MET30	YIL046W	1923 nt		7.52	□□□□□ -1.2
PPN1	Q04119	RMA1	YKL132C	1293 nt		7.52	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	YNL190W	YNL190W	615 nt		7.52	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	ARO3	YDR035W	1113 nt		7.51	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	SNP1	YIL061C	903 nt		7.5	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	AIM34	YMR003W	597 nt		7.5	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	MET13	YGL125W	1803 nt		7.5	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	KTR4	YBR199W	1395 nt		7.49	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	CPR2	YHR057C	618 nt		7.49	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	ITR1	YDR497C	1755 nt		7.48	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	CBK1	YNL161W	2271 nt		7.48	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	YPL247C	YPL247C	1572 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	STS1	YIR011C	960 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	MGM101	YJR144W	810 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	YML079W	YML079W	606 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	SWP1	YMR149W	861 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	RPR1	RPR1	369 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	NSG2	YNL156C	900 nt		7.47	□□□□□ -1.21
PPN1	Q04119	ERV2	YPR037C	591 nt		7.46	□□□□□ -1.22
PPN1	Q04119	PRC1	YMR297W	1599 nt		7.46	□□□□□ -1.22
PPN1	Q04119	YHR131C	YHR131C	2553 nt		7.45	□□□□□ -1.22
PPN1	Q04119	TES1	YJR019C	1050 nt		7.45	□□□□□ -1.22
PPN1	Q04119	YPL264C	YPL264C	1062 nt		7.45	□□□□□ -1.22
PPN1	Q04119	LAS17	YOR181W	1902 nt		7.44	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms