Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 SRP102YKL154W 735 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 IPL1YPL209C 1104 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 ADE17YMR120C 1779 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 CMR1YDL156W 1569 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 CHS5YLR330W 2016 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 PRP2YNR011C 2631 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 NMD5YJR132W 3147 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YBR232CYBR232C 360 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 DUS3YLR401C 2007 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 TIF3YPR163C 1311 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 ATF1YOR377W 1578 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 BUD31YCR063W 474 nt7.24□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YGR137WYGR137W 375 nt7.24□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 INP54YOL065C 1155 nt7.24□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 FHN1YGR131W 525 nt7.23□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 INM1YHR046C 888 nt7.23□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YFR006WYFR006W 1608 nt7.23□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 ABP1YCR088W 1779 nt7.23□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 MKK1YOR231W 1527 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 ERO1YML130C 1692 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 TGL5YOR081C 2250 nt7.21□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 LRO1YNR008W 1986 nt7.21□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 TDA4YJR116W 840 nt7.21□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 RCF1YML030W 480 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 YNL165WYNL165W 1221 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 AGP2YBR132C 1791 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 PFS2YNL317W 1398 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 AIM3YBR108W 2844 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 GLY1YEL046C 1164 nt7.18□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 MET22YOL064C 1074 nt7.18□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 TFC6YDR362C 2019 nt7.18□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 HST2YPL015C 1074 nt7.17□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 MET30YIL046W 1923 nt7.17□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 TIF2YJL138C 1188 nt7.16□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 TIF1YKR059W 1188 nt7.16□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 YMR166CYMR166C 1107 nt7.16□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 RHO1YPR165W 630 nt7.16□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 WSC3YOL105C 1671 nt7.16□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 GAA1YLR088W 1845 nt7.15□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 YPT31YER031C 672 nt7.15□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 SEN2YLR105C 1134 nt7.15□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 MRP7YNL005C 1116 nt7.15□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 MDH2YOL126C 1134 nt7.15□□□□□ -1.26
SPC19Q03954 GYP8YFL027C 1494 nt7.15□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 THI73YLR004C 1572 nt7.15□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 HTS1YPR033C 1641 nt7.15□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 DAL4YIR028W 1908 nt7.15□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 OCH1YGL038C 1443 nt7.14□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 SER2YGR208W 930 nt7.14□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 HSV2YGR223C 1347 nt7.14□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 HMS2YJR147W 1077 nt7.14□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 EHT1YBR177C 1356 nt7.14□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 PDC6YGR087C 1692 nt7.13□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 SLM3YDL033C 1254 nt7.13□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 KTR4YBR199W 1395 nt7.12□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 YGR210CYGR210C 1236 nt7.12□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.12□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 RNA170RNA170 169 nt7.12□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 FRT1YOR324C 1809 nt7.12□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 PUP3YER094C 618 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 CAK1YFL029C 1107 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 YJL064WYJL064W 396 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 NAP1YKR048C 1254 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 LSP1YPL004C 1026 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 FCY1YPR062W 477 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 MRN1YPL184C 1839 nt7.11□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 DIP5YPL265W 1827 nt7.09□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.09□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 YNL190WYNL190W 615 nt7.09□□□□□ -1.27
SPC19Q03954 CDC11YJR076C 1248 nt7.08□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 PAU19YMR325W 375 nt7.08□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YDR401WYDR401W 564 nt7.07□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 RRT14YIL127C 621 nt7.07□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YBL070CYBL070C 321 nt7.07□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YMR206WYMR206W 942 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 OST3YOR085W 1053 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 PRE10YOR362C 867 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YPL108WYPL108W 507 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 HSM3YBR272C 1443 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 MSN2YMR037C 2115 nt7.06□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 ALG7YBR243C 1347 nt7.05□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 CTF3YLR381W 2202 nt7.05□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YPR084WYPR084W 1371 nt7.05□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 GGC1YDL198C 903 nt7.04□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 ARO3YDR035W 1113 nt7.04□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 ORM1YGR038W 669 nt7.04□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 SNP1YIL061C 903 nt7.04□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 PAP2YOL115W 1755 nt7.03□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 SHC1YER096W 1539 nt7.03□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 YPL264CYPL264C 1062 nt7.03□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 OPT1YJL212C 2400 nt7.03□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 WSC4YHL028W 1818 nt7.03□□□□□ -1.28
SPC19Q03954 IME2YJL106W 1938 nt7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.5 ms