Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
COL10A1Q03692 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL10A1Q03692 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COL10A1Q03692 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL10A1Q03692 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL10A1Q03692 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL10A1Q03692 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL10A1Q03692 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL10A1Q03692 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL10A1Q03692 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL10A1Q03692 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL10A1Q03692 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL10A1Q03692 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL10A1Q03692 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL10A1Q03692 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL10A1Q03692 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL10A1Q03692 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL10A1Q03692 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL10A1Q03692 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COL10A1Q03692 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL10A1Q03692 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL10A1Q03692 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COL10A1Q03692 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL10A1Q03692 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
COL10A1Q03692 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL10A1Q03692 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL10A1Q03692 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL10A1Q03692 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL10A1Q03692 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms