Protein–RNA interactions for Protein: Q03691

ROT1, Protein ROT1, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT1Q03691 JHD1YER051W 1479 nt7.54□□□□□ -1.2
ROT1Q03691 NUP53YMR153W 1428 nt7.53□□□□□ -1.2
ROT1Q03691 THI6YPL214C 1623 nt7.53□□□□□ -1.2
ROT1Q03691 HXT8YJL214W 1710 nt7.53□□□□□ -1.2
ROT1Q03691 YJL043WYJL043W 774 nt7.53□□□□□ -1.2
ROT1Q03691 YLR072WYLR072W 2082 nt7.52□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 TIM50YPL063W 1431 nt7.52□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 FUS3YBL016W 1062 nt7.51□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 BNA3YJL060W 1335 nt7.51□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 MAS1YLR163C 1389 nt7.5□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 MPC1YGL080W 393 nt7.5□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.5□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 PMU1YKL128C 888 nt7.5□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 PRE10YOR362C 867 nt7.49□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 PZF1YPR186C 1290 nt7.49□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 PET494YNR045W 1470 nt7.49□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 RCF1YML030W 480 nt7.48□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 HXT11YOL156W 1704 nt7.48□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 GET2YER083C 858 nt7.47□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 DIP5YPL265W 1827 nt7.47□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 MAE1YKL029C 2010 nt7.47□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 MFG1YDL233W 1377 nt7.46□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 ABP1YCR088W 1779 nt7.46□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 TPO4YOR273C 1980 nt7.46□□□□□ -1.21
ROT1Q03691 NBA1YOL070C 1506 nt7.46□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 INO1YJL153C 1602 nt7.45□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 SIR2YDL042C 1689 nt7.45□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.45□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 MRPL36YBR122C 534 nt7.45□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 SRM1YGL097W 1449 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 PSP2YML017W 1782 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 BUD31YCR063W 474 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 HAC1YFL031W 717 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 IDP3YNL009W 1263 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 YNL234WYNL234W 1281 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 HIS3YOR202W 663 nt7.44□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 RRT6YGL146C 936 nt7.43□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 ESBP6YNL125C 2022 nt7.42□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 ATG22YCL038C 1587 nt7.42□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 MRS3YJL133W 945 nt7.42□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 APT1YML022W 564 nt7.42□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 LEA1YPL213W 717 nt7.42□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 BAP3YDR046C 1815 nt7.41□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 YDR476CYDR476C 675 nt7.41□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 ARO3YDR035W 1113 nt7.4□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 NCA3YJL116C 1014 nt7.4□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 OCA1YNL099C 717 nt7.4□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 ALG7YBR243C 1347 nt7.4□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 NDE2YDL085W 1638 nt7.4□□□□□ -1.22
ROT1Q03691 WSC3YOL105C 1671 nt7.39□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 SPR1YOR190W 1338 nt7.39□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 MMS21YEL019C 804 nt7.39□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 CPT1YNL130C 1182 nt7.39□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 PNS1YOR161C 1620 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 PCL10YGL134W 1302 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 ARG7YMR062C 1326 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 TAF4YMR005W 1167 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 BSP1YPR171W 1731 nt7.38□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YDR306CYDR306C 1437 nt7.37□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 WSC4YHL028W 1818 nt7.37□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 TDA4YJR116W 840 nt7.37□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 PRE5YMR314W 705 nt7.37□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YHL008CYHL008C 1884 nt7.36□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 MRN1YPL184C 1839 nt7.36□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 GLY1YEL046C 1164 nt7.36□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 COA2YPL189C-A 207 nt7.36□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YGR137WYGR137W 375 nt7.35□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 SNP1YIL061C 903 nt7.35□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YML079WYML079W 606 nt7.35□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 TGL5YOR081C 2250 nt7.35□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 GAT1YFL021W 1533 nt7.34□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 SUA5YGL169W 1281 nt7.34□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 CWC25YNL245C 540 nt7.34□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 YPR150WYPR150W 522 nt7.34□□□□□ -1.23
ROT1Q03691 PUS7YOR243C 2031 nt7.34□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 RRP1YDR087C 837 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 YLR358CYLR358C 564 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 MRP7YNL005C 1116 nt7.33□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 DST1YGL043W 930 nt7.32□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.32□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 YLR036CYLR036C 612 nt7.32□□□□□ -1.24
ROT1Q03691 ILV2YMR108W 2064 nt7.32□□□□□ -1.24
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