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Protein–RNA interactions for Protein: Q03691
ROT1, Protein ROT1, yeast
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256 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROT1
Q03691
JHD1
YER051W
1479 nt
7.54
□□□□□ -1.2
ROT1
Q03691
NUP53
YMR153W
1428 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ROT1
Q03691
THI6
YPL214C
1623 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ROT1
Q03691
HXT8
YJL214W
1710 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ROT1
Q03691
YJL043W
YJL043W
774 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ROT1
Q03691
YLR072W
YLR072W
2082 nt
7.52
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
TIM50
YPL063W
1431 nt
7.52
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
FUS3
YBL016W
1062 nt
7.51
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
BNA3
YJL060W
1335 nt
7.51
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
MAS1
YLR163C
1389 nt
7.5
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
MPC1
YGL080W
393 nt
7.5
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
YHL030W-A
YHL030W-A
462 nt
7.5
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
PMU1
YKL128C
888 nt
7.5
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
PRE10
YOR362C
867 nt
7.49
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
PZF1
YPR186C
1290 nt
7.49
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
PET494
YNR045W
1470 nt
7.49
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
RCF1
YML030W
480 nt
7.48
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
HXT11
YOL156W
1704 nt
7.48
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
GET2
YER083C
858 nt
7.47
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
DIP5
YPL265W
1827 nt
7.47
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
MAE1
YKL029C
2010 nt
7.47
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
MFG1
YDL233W
1377 nt
7.46
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
ABP1
YCR088W
1779 nt
7.46
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
TPO4
YOR273C
1980 nt
7.46
□□□□□ -1.21
ROT1
Q03691
NBA1
YOL070C
1506 nt
7.46
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
INO1
YJL153C
1602 nt
7.45
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
SIR2
YDL042C
1689 nt
7.45
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
YMR306C-A
YMR306C-A
390 nt
7.45
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
MRPL36
YBR122C
534 nt
7.45
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
SRM1
YGL097W
1449 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
PSP2
YML017W
1782 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
BUD31
YCR063W
474 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
HAC1
YFL031W
717 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
IDP3
YNL009W
1263 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
YNL234W
YNL234W
1281 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
HIS3
YOR202W
663 nt
7.44
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
RRT6
YGL146C
936 nt
7.43
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
ESBP6
YNL125C
2022 nt
7.42
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
ATG22
YCL038C
1587 nt
7.42
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
MRS3
YJL133W
945 nt
7.42
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
APT1
YML022W
564 nt
7.42
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
LEA1
YPL213W
717 nt
7.42
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
BAP3
YDR046C
1815 nt
7.41
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
YDR476C
YDR476C
675 nt
7.41
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
ARO3
YDR035W
1113 nt
7.4
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
NCA3
YJL116C
1014 nt
7.4
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
OCA1
YNL099C
717 nt
7.4
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
ALG7
YBR243C
1347 nt
7.4
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
NDE2
YDL085W
1638 nt
7.4
□□□□□ -1.22
ROT1
Q03691
WSC3
YOL105C
1671 nt
7.39
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
SPR1
YOR190W
1338 nt
7.39
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
MMS21
YEL019C
804 nt
7.39
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
CPT1
YNL130C
1182 nt
7.39
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
PNS1
YOR161C
1620 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
PCL10
YGL134W
1302 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
ARG7
YMR062C
1326 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
TAF4
YMR005W
1167 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YRF1-3
YGR296W
5580 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YRF1-6
YNL339C
5580 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YRF1-7
YPL283C
5580 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
BSP1
YPR171W
1731 nt
7.38
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YDR306C
YDR306C
1437 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
WSC4
YHL028W
1818 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
TDA4
YJR116W
840 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
PRE5
YMR314W
705 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YHL008C
YHL008C
1884 nt
7.36
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
MRN1
YPL184C
1839 nt
7.36
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
GLY1
YEL046C
1164 nt
7.36
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
COA2
YPL189C-A
207 nt
7.36
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YGR137W
YGR137W
375 nt
7.35
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
SNP1
YIL061C
903 nt
7.35
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YML079W
YML079W
606 nt
7.35
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
TGL5
YOR081C
2250 nt
7.35
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
GAT1
YFL021W
1533 nt
7.34
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
SUA5
YGL169W
1281 nt
7.34
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
CWC25
YNL245C
540 nt
7.34
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
YPR150W
YPR150W
522 nt
7.34
□□□□□ -1.23
ROT1
Q03691
PUS7
YOR243C
2031 nt
7.34
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
RRP1
YDR087C
837 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)B
tD(GUC)B
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)D
tD(GUC)D
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)G1
tD(GUC)G1
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)G2
tD(GUC)G2
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)I1
tD(GUC)I1
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)I2
tD(GUC)I2
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)J1
tD(GUC)J1
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)J2
tD(GUC)J2
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)J3
tD(GUC)J3
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)J4
tD(GUC)J4
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)K
tD(GUC)K
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)L1
tD(GUC)L1
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)L2
tD(GUC)L2
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)M
tD(GUC)M
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
tD(GUC)O
tD(GUC)O
72 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
YLR358C
YLR358C
564 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
MRP7
YNL005C
1116 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
DST1
YGL043W
930 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
YAL016C-B
YAL016C-B
186 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
YLR036C
YLR036C
612 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ROT1
Q03691
ILV2
YMR108W
2064 nt
7.32
□□□□□ -1.24
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