Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFHR1Q03591 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFHR1Q03591 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHR1Q03591 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms