Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr1Q03146 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddr1Q03146 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr1Q03146 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddr1Q03146 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms