Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 SNU71YGR013W 1863 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 SLD7YOR060C 774 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 ITR2YOL103W 1830 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 HXT13YEL069C 1695 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 DAL4YIR028W 1908 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 ENO2YHR174W 1314 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 AIM3YBR108W 2844 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 EDC2YER035W 438 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 VMA11YPL234C 495 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 PRE2YPR103W 864 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 ERG13YML126C 1476 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 FET5YFL041W 1869 nt7.54□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 TAF4YMR005W 1167 nt7.54□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 YIL177CYIL177C 5277 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 AMF1YOR378W 1548 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 NUP57YGR119C 1626 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 MRPL24YMR193W 777 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP1Q02821 MRP1YDR347W 966 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YGR210CYGR210C 1236 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 INP54YOL065C 1155 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 RIM2YBR192W 1134 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 LEU2YCL018W 1095 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 HBS1YKR084C 1836 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 HOG1YLR113W 1308 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 KRR1YCL059C 951 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 REV7YIL139C 738 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 OPI3YJR073C 621 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YKR012CYKR012C 378 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 AVO2YMR068W 1281 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 ENO1YGR254W 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 ERO1YML130C 1692 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 CDS1YBR029C 1374 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 TPC1YGR096W 945 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 DSE3YOR264W 1293 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 FCY1YPR062W 477 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 GAT1YFL021W 1533 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 SAC7YDR389W 1965 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YIL092WYIL092W 1902 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 FET4YMR319C 1659 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 RPC31YNL151C 756 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 OST3YOR085W 1053 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 SNX3YOR357C 489 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 SDS24YBR214W 1584 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YLR280CYLR280C 351 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 TAF11YML015C 1041 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 YNR048WYNR048W 1182 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 MIM1YOL026C 342 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 ATP4YPL078C 735 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 MRPL36YBR122C 534 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 SGE1YPR198W 1632 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP1Q02821 EMC3YKL207W 762 nt7.46□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YPL108WYPL108W 507 nt7.46□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 DUS3YLR401C 2007 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 LSM12YHR121W 564 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YHR140WYHR140W 720 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YNL040WYNL040W 1371 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YMR206WYMR206W 942 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 DPL1YDR294C 1770 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YJL160CYJL160C 864 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 INH1YDL181W 258 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 LYS12YIL094C 1116 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 MIX17YMR002W 471 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YNL234WYNL234W 1281 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YNR064CYNR064C 873 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YMR265CYMR265C 1386 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 GYP8YFL027C 1494 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 CIT3YPR001W 1461 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 NAM8YHR086W 1572 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 SHO1YER118C 1104 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 TIF2YJL138C 1188 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 ELO1YJL196C 933 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 TIF1YKR059W 1188 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YOL079WYOL079W 399 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 CTR1YPR124W 1221 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 GDH1YOR375C 1365 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 CDC10YCR002C 969 nt7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.7 ms