Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms