Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL18AQ02543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPL18AQ02543 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL18AQ02543 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms