Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OC90Q02509 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OC90Q02509 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OC90Q02509 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OC90Q02509 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OC90Q02509 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OC90Q02509 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OC90Q02509 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OC90Q02509 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
OC90Q02509 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OC90Q02509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OC90Q02509 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OC90Q02509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OC90Q02509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OC90Q02509 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OC90Q02509 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OC90Q02509 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OC90Q02509 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OC90Q02509 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OC90Q02509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OC90Q02509 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OC90Q02509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OC90Q02509 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OC90Q02509 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OC90Q02509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OC90Q02509 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OC90Q02509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OC90Q02509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OC90Q02509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OC90Q02509 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OC90Q02509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OC90Q02509 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OC90Q02509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OC90Q02509 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OC90Q02509 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OC90Q02509 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OC90Q02509 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OC90Q02509 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OC90Q02509 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OC90Q02509 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OC90Q02509 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OC90Q02509 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OC90Q02509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OC90Q02509 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OC90Q02509 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OC90Q02509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OC90Q02509 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OC90Q02509 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OC90Q02509 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OC90Q02509 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OC90Q02509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OC90Q02509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OC90Q02509 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OC90Q02509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OC90Q02509 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OC90Q02509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OC90Q02509 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OC90Q02509 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OC90Q02509 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OC90Q02509 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OC90Q02509 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OC90Q02509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OC90Q02509 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OC90Q02509 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OC90Q02509 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OC90Q02509 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OC90Q02509 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OC90Q02509 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OC90Q02509 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OC90Q02509 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OC90Q02509 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OC90Q02509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OC90Q02509 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OC90Q02509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OC90Q02509 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OC90Q02509 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OC90Q02509 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OC90Q02509 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OC90Q02509 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OC90Q02509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OC90Q02509 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OC90Q02509 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OC90Q02509 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OC90Q02509 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms