Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JupQ02257 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JupQ02257 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
JupQ02257 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JupQ02257 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JupQ02257 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JupQ02257 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JupQ02257 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JupQ02257 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JupQ02257 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JupQ02257 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JupQ02257 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JupQ02257 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JupQ02257 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JupQ02257 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JupQ02257 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JupQ02257 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JupQ02257 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
JupQ02257 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JupQ02257 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JupQ02257 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JupQ02257 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JupQ02257 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JupQ02257 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JupQ02257 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JupQ02257 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JupQ02257 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JupQ02257 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JupQ02257 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JupQ02257 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JupQ02257 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JupQ02257 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JupQ02257 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JupQ02257 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JupQ02257 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JupQ02257 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JupQ02257 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JupQ02257 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JupQ02257 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JupQ02257 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JupQ02257 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JupQ02257 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JupQ02257 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JupQ02257 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JupQ02257 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
JupQ02257 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JupQ02257 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JupQ02257 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JupQ02257 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JupQ02257 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JupQ02257 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JupQ02257 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JupQ02257 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JupQ02257 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JupQ02257 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JupQ02257 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JupQ02257 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JupQ02257 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JupQ02257 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JupQ02257 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JupQ02257 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JupQ02257 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JupQ02257 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JupQ02257 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JupQ02257 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JupQ02257 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JupQ02257 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JupQ02257 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JupQ02257 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
JupQ02257 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JupQ02257 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JupQ02257 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JupQ02257 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JupQ02257 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JupQ02257 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JupQ02257 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JupQ02257 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JupQ02257 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JupQ02257 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JupQ02257 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JupQ02257 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JupQ02257 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JupQ02257 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
JupQ02257 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JupQ02257 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JupQ02257 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JupQ02257 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JupQ02257 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms