Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTN2Q02246 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CNTN2Q02246 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTN2Q02246 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTN2Q02246 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN2Q02246 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms