Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX6A2Q02221 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX6A2Q02221 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A2Q02221 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms