Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FLI1Q01543 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FLI1Q01543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FLI1Q01543 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FLI1Q01543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms