Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp1Q01514 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp1Q01514 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp1Q01514 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gbp1Q01514 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms