Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMP22Q01453 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMP22Q01453 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms