Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbbp6P97868 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rbbp6P97868 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rbbp6P97868 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbbp6P97868 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp6P97868 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rbbp6P97868 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms