Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Neo1P97798 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Neo1P97798 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Neo1P97798 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Neo1P97798 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Neo1P97798 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Neo1P97798 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neo1P97798 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Neo1P97798 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neo1P97798 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neo1P97798 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Neo1P97798 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Neo1P97798 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Neo1P97798 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Neo1P97798 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Neo1P97798 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Neo1P97798 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Neo1P97798 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Neo1P97798 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Neo1P97798 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Neo1P97798 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Neo1P97798 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Neo1P97798 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Neo1P97798 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Neo1P97798 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Neo1P97798 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Neo1P97798 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Neo1P97798 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Neo1P97798 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Neo1P97798 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Neo1P97798 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Neo1P97798 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Neo1P97798 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Neo1P97798 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms