Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps45P97390 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps45P97390 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps45P97390 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps45P97390 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps45P97390 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps45P97390 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps45P97390 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps45P97390 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps45P97390 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps45P97390 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps45P97390 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps45P97390 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps45P97390 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps45P97390 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps45P97390 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms