Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nkx2-3P97334 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Nkx2-3P97334 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nkx2-3P97334 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nkx2-3P97334 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-3P97334 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx2-3P97334 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms