Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mesp1P97309 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mesp1P97309 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mesp1P97309 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms