Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS9P82933 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS9P82933 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS9P82933 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPS9P82933 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms