Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM189BP81408 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM189BP81408 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM189BP81408 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
FAM189BP81408 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM189BP81408 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM189BP81408 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM189BP81408 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM189BP81408 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM189BP81408 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM189BP81408 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM189BP81408 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM189BP81408 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM189BP81408 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM189BP81408 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM189BP81408 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM189BP81408 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM189BP81408 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM189BP81408 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM189BP81408 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM189BP81408 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM189BP81408 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM189BP81408 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FAM189BP81408 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM189BP81408 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM189BP81408 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.4 ms